Biodegradasi adalah proses dimana bahan organik yang diuraikan oleh enzim dihasilkan oleh organisme hidup. 

Cara-cara yang dapat meningkatkan kemampuan biodegradasi adalah

• menggunakan mikroba indegenus (mikroba asli ditempat pencemaran yang berpotensi mendegradasi limbah),
• memodifikasi lingkungan dengan penambahan nutrisi dan aerasi dengan tujuan untuk menyediakan kondisi pertumbuhan optimal untuk bakteri pendegradasi, dan
• penambahan mikroorganisme yang bisa mendegradasi limbah.

Jadi yang tidak termasuk dalam usaha untuk meningkatkan kemampuan biodegradasi adalah penambahan desinfektan ke area limbah yang ingin didegradasi. Penambahan desinfektan ini bisa membunuh bakteri pendegradasi.