Sel tumbuhan tidak memiliki lisosom seperti sel hewan. Namun, sel tumbuhan memiliki vakuola yang memiliki fungsi yang hampir sama dengan lisosom tersebut. Pada tanaman zat-zat bersifat toksik dan beracun disimpan dalam vakuola seperti fungsi lisosom pada sel hewan. Selain itu, vakuola juga berperan dalam penghancuran sel-sel tumbuhan yang sudah tua.

Jadi fungsi lisosom pada sel tumbuhan digantikan dengan organel vakuola.

*Mitokondria berperan dalam respirasi seluler.

*Retikulum endoplasma berperan dalam sintesis protein, lemak dan senyawa lainnya.

*Ribosom berperan sebagai tempat sintesis protein.

*Peroksisom mengandung enzim katalase yang akan mengoksidasi senyawa hidrogen peroksida agar tidak berbahaya di dalam tubuh manusia.