Warna mata pada manusia ditentukan oleh sel-sel pewarna yang disebut melanosit. Sel melanosit sendiri terdiri dari dua jenis pigmen, yaitu eumelanin (penghasil warna cokelat) dan pheomelanin (penghasil warna merah). Pada mata, sel melanosit terletak pada iris. Semakin banyak eumelanin di dalam iris, warna mata akan semakin gelap. Sebanyak 55% manusia di dunia memiliki warna mata cokelat kehitaman. Sebaliknya, semakin banyak pheomelanin di iris, maka warna mata akan semakin terang.

Jadi bagian pada mata yang menjadi faktor penentu perbedaan warna mata adalah iris.

*Pupil untuk mengatur jumlah cahaya yang masuk ke mata.

*Retina untuk membentuk bayangan benda.

*Lensa mata untuk memfokuskan bayangan benda agar jatuh pada retina.

*Sklera untuk memberi bentuk bola mata dan melekatnya otot.